O CIMA é constituído por uma equipa nuclear composta por 47 investigadores. As suas atividades estão estruturadas em 2 áreas de investigação (Dinâmica oceânica e costeira; Sistemas e recursos ambientais) que trabalham juntos para alcançar os objetivos a seguir:


1 - Compreender a dinâmica dos oceanos (da costa ao oceano aberto)
2 - Desenvolvimento de uma exploração sustentável de recursos
3 - Avaliação e mitigação de alterações globais e riscos
4 - Capitalizar o conhecimento para uma sociedade sustentável e resiliente